琼脂糖凝胶是由β-D-半乳糖和3,6-脱水-L-半乳糖交替结合所形成的线性多聚糖。利用纯化的琼脂糖热溶液冷却时能凝胶化的特点，可较方便地制成珠状物。在凝胶过程中由单独的多糖链先形成双螺旋，然后聚集成胶束，胶束之间形成微孔，其大小取决于胶束的多少，即琼脂糖的浓度。采用不同浓度的琼脂糖溶液，成球后可得到不同孔径的球状凝胶。最终凝胶结构=琼脂糖凝胶结构。

      Sepharose是琼脂糖系中最早的产品，为非交联结构，不能高压灭菌，仅用于2～40℃范围，按琼脂糖含量为2%、4%、6%分成2B、4B及6B三种型号，可用于分离核苷酸类化合物。

      琼脂糖凝胶4FF、6FF是高度偶联的琼脂糖凝胶，机械性能大大增强，流速快，适合工业制备生产。化学稳定性高，可用多种促溶剂、有机溶剂操作和1～2M NaOH在位清洗。